公积金还贷款的扣款方式主要有以下几种：
自动扣款
年冲方式：每年办理一次部分提前还款，优先偿还公积金贷款本金，每月月还款需自行使用现金归还。
月冲方式：每月直接从公积金账户中提取用于归还当月贷款本息，提取的公积金金额不足时需自行补足。
一次性还款法
每年一次向受托行提取住房公积金账户余额，一次性冲还贷款本金，之后每月的还款需使用客户自有资金。
逐月还款法
每月从公积金账户中提取用于归还当月贷款本息，提取金额不超过上月的月还款额，提取后保留公积金月缴额的6倍。
按期还款
贷款时绑定银行卡，每月还款日系统从绑定的银行卡中扣款。
具体扣款流程：
签订贷款合同：
在购房时申请公积金贷款，并与银行或公积金管理中心签订贷款合同，合同中会约定还款方式和时间。
存入还款金额：
在还款日前，将当期应还的贷款金额存入个人公积金账户中。
自动扣款：
在还款日，公积金管理中心根据贷款合同约定的还款方式和时间，自动从公积金账户中扣除当期的贷款还款金额。如果公积金账户余额不足，系统会自动从绑定的还款银行卡中扣除储蓄余额，直到当月的公积金贷款本息全额还清。
建议：
提前存款：为确保还款顺利进行，建议在还款日前确保公积金账户和还款银行卡中有足够的余额。
了解还款方式：选择适合自己的还款方式，年冲适合希望一次性减少贷款本金的借款人，月冲则适合每月还款压力较大的借款人。
咨询公积金管理中心：在办理公积金贷款前，咨询当地公积金管理中心，了解详细的还款流程和注意事项。
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