工程预付款的计算方法主要有两种：
百分比法
工程预付款 = （中标合同价 - 不属于承包商的费用） × 预付款比例
预付款比例通常在10%至30%之间，具体比例根据工程类型、工期、市场行情等因素由发承包双方协商确定。
数学计算法
工程预付款 = 合同造价 × 材料比重 × 材料储备天数 / 年度施工天数
其中，材料储备天数通常根据工程的具体需求和市场供应情况确定。
预付备料款限额的计算公式为：
备料款限额 = 年度承包工程总值 × 主要材料所占比重 × 年度施工日历天数 × 材料储备天数
一般建筑工程不应超过当年建筑工作量的30%，安装工程按年安装工作量的10%左右拨付。
预付款的扣回方法通常是从未施工工程尚需的主要材料及构件的价值相当于备料款数额时起扣，从每次结算工程价款中按材料比重扣抵工程价款，直至竣工前全部扣清。
请注意，这些计算方法应遵循发承包双方合同中的具体约定，并考虑工程的实际情况。
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