处理国有企业小金库的问题，需要遵循以下步骤和原则：将小金库的资金或资产纳入国家规定的账簿内，进行统一登记和核算。对于财政性资金，应依照规定缴入国库或上交财政专户。对于设立或使用小金库的国有及国有控股企业、事业单位，对相关责任人员，如负有责任
